二者的主要区别如下：
第一、 毛发不同：其中圣伯纳犬分短毛和长毛两种：其中短毛类的外层被毛厚，平滑，紧贴身体并且粗，下层被毛多，大腿被毛稍象马裤，尾部被毛密，长毛类的外层被毛平坦，长度适中，下层被毛多，脸、耳被毛短，臀、胯部的被毛通常有点卷曲，前腿被毛稀薄，大腿上有“马裤”样被毛，尾巴被毛密；而中亚为双层被毛,外毛粗糙、长,底毛柔软、纤细，嘴巴、前额和前腿的毛会短且光滑。
第二、 鼻子不同：其中圣伯纳犬的鼻子十分坚实、宽阔、带有宽大的鼻孔，象嘴唇一样，必须为黑色；而中亚的鼻子大、宽、黑色，而浅色的狗也有棕色的鼻子。
