其区别主要体现在以下几个方面：
1. 辖区范围不同：杭州市公积金是指在杭州市范围内实施的公积金制度，而浙江省公积金是指在整个浙江省范围内实施的公积金制度。杭州市公积金是浙江省公积金体系的一部分。
2. 管理机构不同：杭州市公积金由杭州市住房公积金管理中心负责管理和运营，而浙江省公积金由浙江省住房公积金管理中心负责管理和运营。
3. 缴纳规则和政策不同：尽管杭州市公积金和浙江省公积金在缴费比例和基数上可能有所不同，但总体来说，它们遵循的原则和规则是相似的。具体的缴纳规则和政策通常由各自的管理机构制定，并受到当地政府相关规定的影响。
