基因图谱是指在一定范围内，用基因标记在染色体上关联位点的空间分布图。它是一种表述基因关系的图谱，即以整个染色体上的遗传变异为研究对象，将染色体上所有标记元件的相对位置关系，以物理距离或遗传距离的形式进行统计和描述。
基因图谱可用来描述基因遗传位点、染色体平移等现象，也可作为染色体结构异常和基因突变的参考标准。
常用的基因图谱包括的研究方法有多态性分析、人工合成等，常见的基因图谱类型包括人类基因图谱、小麦基因图谱、水稻基因图谱等。基因图谱的研究对于深入了解遗传信息，揭示基因遗传规律，对于遗传病的研究和治疗，以及作物育种等都具有重要的意义。
基因图谱是指综合各种方法绘制成的基因在染色体上的线性排列图。生物的性状千差万别，决定这些性状的基因成千上万。这些基因成群地存在于遗传物质的载体——染色体上。
基因定位就是要确定基因所在的染色体，并测定基因在特定染色体上线性排列的顺序和相对距离。通过测定重组率得到的基因线性排列图称为遗传图谱，将遗传重组值作为基因间距离，所得到的线性排列图称为连锁图谱，用其他一些方法确定基因在染色体上的实际位置制成的图谱称为物理图谱。
