因为宇智波一族要发动叛乱，为了村子的稳定，宇智波鼬决定灭族。
鼬是个非常热爱村子的人，受止水的影响，认为忍者是为了实现目标而忍辱负重的人，因此他自愿成为了罪人而灭族，背负了整个木叶和佐助的仇恨与黑暗。
宇智波鼬为什么要灭宇智波一族
宇智波鼬强、帅、善都在他身上体现出，鼬灭掉全族也是被逼无奈别无他法的选择，在第三次忍者界大战，鼬年仅4岁就目睹了太多的死亡，这对他的内心产生了巨大的重创，导致他成为一个厌恶战争，爱好和平的男人。
宇智波鼬能够团灭宇智波一族，一是因为他得到了同样拥有万花筒写轮眼的宇智波带土的帮助；二是因为鼬特意挑在夜晚动手，使得宇智波族人疏于防备；三是因为宇智波一族并非全员都是写轮眼的开眼者，其中仍有部分没什么战斗力的普通人；四是因为实力最强的宇智波一族的族长宇智波富岳选择放弃抵抗，甘愿死于宇智波鼬之手，这就使得鼬的灭族计划能够更加顺利地完成。
