磷酸基团一般是指磷酸酰基，即磷酸脱去一个羟基的结构，也可以是脱去两个羟基的磷酸基团，比如ATP、核苷酸等；而磷酸就是指无机物磷酸，一般是以分子形式存在。磷酸基团具有很强的配合能力，能与许多金属离子生成可溶性的配合物。如Fe3+与PO43-可以生成无色的可溶性的配合物[Fe(PO4)2]3-和[Fe(HPO4)2]-；而磷酸属于二元中强酸，可以与各种碱性物质和金属发生反应，也可以用于制备其它酸。
磷酸基团与磷酸的区别在于：
一、磷酸是一种独立存在的物质。
二、磷酸基团是通过化学键连接在其他物质上时的磷酸，磷酸基团是不能独立存在的。
三、dna与atp中叫法不同是因为：dna稳定，dna上的磷酸一直存在于dna上，只有一种形态，无需多种叫法，称之为磷酸即可（也可叫做磷酸基团）。
四、atp不稳定，apt上的磷酸易水解，这时磷酸基团就会变成磷酸，为了方便学习，所以这里叫法分开了。
磷酸的结构简式是:O←P(OH)3
