行政事业单位财务收支审计的主要内容：
一、审查行政事业单位预算编制的合法性，执行的规范性。审查预算收入的合法性、真实性，审查预算执行、决算编报的真实性、完整性，是否真实地反映了预算拨款情况；上级补助经费是否及时完整入账，有无账外设账、隐瞒转移资金的问题。
二、审查各项支出的合法性、真实性、效益性。检查财政预算拨款和上级补助经费支出是否按财政批复的部门预算用途和标准使用资金，专项资金是否专款专用。
三、审查行政性收费及收取罚没款的合法性、完整性、及时性。行政性收费、罚款依据和标准是否合法，是否实行了收缴、罚缴、票款分离，是否及时上缴国库，纳入财政预算等问题。 行政事业单位财务收支审计是指对行政事业单位的财政、财务收支进行的审计，以确定其财政、财务收支的真实性、合法性，促使其加强财务管理，规范经济活动。
