1.科属不同
绿莲灯鱼，别名：绿霓虹灯，是脂鲤目，脂鲤科，霓虹脂鲤属的淡水鱼类。
宝莲灯鱼，学名阿氏霓虹脂鲤，也叫红莲灯、新日光灯鱼、新红莲灯鱼。是鲤形目、脂鲤亚目、脂鲤科的鱼类。
2.形态特征不同
绿莲灯鱼，体长约3厘米，体形与红绿灯近似，体色透明，体轴从吻端至尾柄末端有一条非常耀眼的蓝色色带，下腹部有时也会有一条较细的蓝色带。
宝莲灯鱼，娇小纤细，体长约在4-5厘米，是热带鱼中的珍品。其体侧扁，呈纺锤形，头、尾柄较宽，吻端圆钝。最明显的特色是在，身体上半部有一条明亮的蓝绿色带，下半部是一条红色色带，全身带有金属光泽，闪闪发光，游动时特别美丽。
