其原因可能是多种多样的，主要有以下几种情况：
1、干旱造成小麦发黄：这类小麦多发生在底墒不足，抢墒播种。当小麦根系从土壤中吸收到的水分难以补偿消耗，其生长发育受到影响致使叶片变黄，严重时死亡。田间表现为整个麦田发黄较一致，分蘖出生慢，生长缓慢或停滞，新叶短小，根小而细。因此播种时应足墒播种。
2、秸秆还田耕层不足：玉米秸秆还田，可以起到改良土壤、培肥地力的作用，现在秸秆还田量大，耕层一般都不足20厘米，使田间部分小麦出苗后根系扎在疏松秸秆上，难以从土壤中吸收养分，造成麦苗发黄。因此提倡深耕深翻，每隔3年应深耕一次，深度应达25厘米。
3、缺肥：小麦氮肥不足或磷肥不足都会造成小麦发黄现象。小麦缺氮型发黄、是指由于播种过早、基肥施得不足或基肥中含氮量低，导致小麦出现发黄现象。植株矮小细弱，分蘖少而弱，幼苗叶片进而发黄。遇到这种情况，应在返青期每亩追施尿素5公斤左右，起身或拔节期每亩再追施尿素12-15公斤。小麦基肥中磷肥施量不足或土壤中缺磷，常使小麦缺磷发黄。田间表现为：次生根极少，分蘖少，叶色暗绿，叶尖黄。小麦缺磷发黄会导致穗小粒少，千粒重下降，严重影响产量。当小麦苗缺磷时，每亩可沟施二铵10公斤或过磷酸钙45-50公斤。
4、小麦播种密度过大：小麦播种密度大，造成小麦群体过大，影响到小麦光合作用，养分供应不足，导致叶片发黄。因此应根据时节、温度适量播种。
5、持续低温、受冻害： 持续低温，光照时间少，小麦苗情整体较弱,受低温冻害影响表现出叶黄。防治措施是寒流到来之后加强管理，喷施叶面肥。
6、病虫害原因：小麦病害主要有纹枯病、全蚀病和根腐病三种。他们都是真菌病害，发生初期都能表现黄叶，但病斑发生的部位和病斑形状有所不同。纹枯病主要危害叶鞘；全蚀病主要危害茎基部和根部；根腐病只发生在根部。它们都是依靠土壤传播的病害，戊唑醇、丙环唑可以兼治这三种病害。地下害虫也可危害小麦造成黄叶。防治的办法是药剂拌种和土壤处理。可用的药剂如辛硫磷、毒死蜱等。
小麦黄叶根茎扁，扎不下根主要由以下几种病原菌引起：小麦纹枯病菌、小麦全蚀病菌、小麦根腐病菌，其引起的相应根病为小麦纹枯病、小麦全蚀病、小麦根腐病。
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