三元猪和二元猪的根本区别是交配品种的不同，二元猪是长白公猪和大白母猪杂交而成的品种。而三元猪是在二元猪优良的基础上再与其他品种进行杂交而得到猪。
简单理解就是二元猪是两个品种杂交的，三元猪就是三个品种杂交的，国内最通用的育种方式是A xB C，A代表杜洛克，B代表长白猪，C代表大白猪，二元猪也叫简杂猪，只用了两个品种，三元猪是用二元猪再杂交另一种公猪，繁育出来的猪，就是三元猪。
外三元：母本、第一父本、第二父本均为外来良种猪，杂交生产出三元杂交瘦肉猪。一般是先用长白猪品种的公猪配大白猪品种的母猪，所产二元杂交种中的母猪长大后，再用杜洛克公猪交配，所生后代叫三元杂交种。三个品种都是国外引进品种，例如长白、大白、杜洛克杂交等。（长白猪＋大白猪＝二元杂交猪，二元杂交猪＋杜洛克＝外三元。） 内三元：以本地优良母猪为母本，一般先用大约克公猪为第一父本，杂交生产出一代杂种母猪即二元母猪，再用杜洛克或长白公猪等作第二父本与二元母猪杂交，生产出三元杂交猪。三个品种中有一到两个我国的品种，如长白、大白、东北民猪等。（大约克公猪＋本地猪＝二元杂交猪，二元杂交猪＋杜洛克/长白猪＝内三元） 感觉就是国内猪和国外猪的区别吧。 百度到的，感觉是这样，不太懂，
