鱼缸换水时，需要进行消毒处理以防止细菌和病毒等有害生物入侵。一种常用的消毒方法是将水加热至沸腾，持续煮沸 10-15 分钟。此外，还可以使用含氯或含溴的消毒剂进行浸泡或喷洒。在完成消毒后，必须排放掉消毒水，并用清洁的水重新填充鱼缸。
鱼缸的水一般用高锰酸钾消毒杀菌。如果鱼缸内没有鱼的话，可以用3-5%浓度的高锰酸钾浸泡鱼缸，30粉红后要倒掉添加新水，如果有鱼的话，浓度就不能这么高了，只能用0.5ppm，否则会对鱼儿造成危害。
如果是给鱼消毒的话，可以用1-2ppm，或者单独浸洗用0.5%浓度的药物。
