柚子树还可以在九月可以进行修剪，并且需要分为秋季初以及秋季末修剪，一般在秋季初对植株进行修剪，可以帮助植株开出更多的花朵，结出更多的果实。修剪柚子树，需要将柚子树枯萎的枝叶以及弱枝，徒长的枝叶修剪干净。避免其继续浪费柚子树的养分，也是为了避免继续消耗养分，无法让柚子树安全过冬。
1.每年3-7月份
每年的3-7月份是柚子树集中生长开花的时节，在此时要及时将徒长枝、病虫枝、枯枝全部去除掉。对于生长过密处的枝条要剪去主干枝条数量的三分之一，注意要分成多次进行，避免果树伤口过多削弱其对于病虫害的抵抗力。此时重在疏剪，尽量不要将主枝剪短，便于柚子树开花结果。对于枝干较粗开花较少的枝条也要及时修剪掉，避免养分的浪费。
2.采果后
一般柚子树采果完毕之后已经步入冬季，此时主要针对柚子树枝条进行修剪。首先就是降低整个柚子树的高度，把那些长度超过3米的枝条剪除大约50厘米，剪除掉多余的分枝只留下骨架枝条即可。底部枝条不能过密，也不能平齐。对于过密枝条要进行疏枝，只留下枝条数量的三分之一即可。对于平齐枝条要通过吊、拉等方法进行调整，以保证柚子树来年可以抽生出大量且健康的新芽和枝条。
