生态工程中的自身性原理指的是生态工程的基本原理。
生态工程的基本原理有以下几点.
（1）物质循环再生原理
物质循环再生原理是指物质在生态系统中循环往复分层分级利用。
原理含义是指：生态系统中, 生物借助能量的不停流动, 一方面不断地从自然界摄取物质并合成新的物质, 另一方面又随时分解为原来的简单物质, 即所谓“再生”, 重新被系统中的生产者植物所吸收利用, 进行着不停顿的物质循环。
例如把废弃物中的物质再利用。
理论基础：物质循环。
意义：可避免环境污染及其对系统稳定性和发展的影响。
（2）物种多样性原理
物种多样性是指地球上动物、植物、微生物等生物种类的丰富程度。物种多样性包括两个方面，其一是指一定区域内的物种丰富程度，可称为区域物种多样性；其二是指生态学方面的物种分布的均匀程度，可称为生态多样性或群落物种多样性。物种多样性是衡量一定地区生物资源丰富程度的一个客观指标。
理论基础：生态系统的抵抗力稳定性。
意义：生物多样性程度可提高系统的抵抗力稳定性,提高系统的生产力
（3）、协调与平衡原理
协调与平衡原理是指生物与环境的协调平衡。
例如：寻找适合于本土生长的物种，移植栽培技术。
理论基础：生物与环境的协调与平衡
意义：生物数量不超过环境承载力,可避免系统的失衡和破坏
（4）、整体性原理
整体性原理强调的是：社会、自然、经济复合系统的统一协调，从而保障系统的平衡与稳定。
例如：珊瑚虫和微生物共生，如果两者分开了都不能生存下去。
理论基础：社会—经济—自然复合系统
意义：统一协调各种关系,保障系统的平衡与稳定
（5）、系统学与工程学原理
系统学和工程学原理包括两个方面：一是系统结构决定其功能；二是整体大于部分之和，突出的是各环节之间的相互作用。
例如：“桑基鱼塘”在解决污染物排放，所依据的原理就是物质循环再生；而人的规划后，使得其中各环节之间有了物质的联系，体现出的就是系统学和工程学原理
a.理论基础：系统的结构决定功能原理：分布式优于集中式和环式。
意义：改善和优化系统的结构以改善功能。
b.理论基础：系统整体性原理：整体大于部分。
意义：保持系统很高的生产力。
