海水鱼缸中的水温对海水生物养殖来说是非常重要的，鱼缸温度应保持在25~27度之间是最好的。若是海水缸低於20度，或是高於30度，都是不利海水生物生存的。海水鱼缸应该摆放没有阳光直射、阴凉的位置，千万不要摆放在落地窗前或是其他会遭受阳光直射的地方。夏天时，还要特别注意保持通风，让环境温度不会过高。
海水鱼缸在设计的时候要注意沉水马达不可以放置过多，应计算所需的过虑水量，并采用适合的马达；在温度过高的状况下可以暂停一些辅助扬水的马达。夏季温度高时，水族鱼缸的灯管设备也是导致水温上升的原因，但灯光对海水鱼缸来说非常重要，所以不可以擅自停用，建议可以适当的调高灯具的位置。使用风扇将气体集中从鱼缸後方排出，可以达到鱼缸对流效果，以此降低温度。
