普通茄苗与嫁接茄苗的主要区别在于根系、移栽难易程度和产量。嫁接茄苗的根系比普通茄苗更粗壮，这使得嫁接茄苗在移栽时更为简单。此外，嫁接茄苗的产量也高于普通茄苗。值得注意的是，嫁接茄子苗的价格通常比普通茄子苗贵好几倍。
根系不同、生长方式不同、养殖技术不同、抵抗病虫害不同、生长需求不同。
嫁接茄子抗逆性强，采收早，植株寿命长，采收期长，自根苗茄子高70～120厘米，单株采收3～12个果实，亩产在3500～5500千克；嫁接茄子株高，可达150～200厘米，单株采收30～50个茄子，亩产达10000千克以上。
根系的区别，嫁接苗比普通苗根系发达些。
生长方式的区别，嫁接苗借助砧木吸收养分，实生苗靠根系吸收。养殖技术的区别，抵抗病虫害的区别，生长需求的区别。
