为创造一个舒适的环境，阳光房设计时应充分利用自然风，以达到空气流通和降温的目的，因此，门窗的位置，开启方式等都需要做精心的设计。为提高阳光房的通风性能，可采用以下方式：
1、通过安装带恒温，恒湿功能的通风系统，自动调节阳光房的温度和湿度。
2、在阳光房顶部开天窗。分为手动和自动两种方式。全自动天窗可配置风雨感应及阳光追踪系统。根据气候条件和室内温度高低自动控制天窗的开启。
最简单，最便宜的方式是通过门（滑动门或折叠门）和窗户通风。然而，为了保持温室的最适温度，特别是在非常阳光明媚的夏日，一个单门可能不会是不够的，对于北方的气候，是值得考虑使用科学方法设计通风。
经济有效的解决方案是天窗。它们会把阳光房上层部分热量和经常潮湿的空气带到外面，这种就是利用物理学现象设置阳光房建筑采光的自然通风系统。在这样一个系统中，房间顶部的室内热空气通过阳光房建筑采光的一个特殊的窗口排出，通过特殊设计的扩散器从外部吸入供给的新鲜空气。这样的设计可以起到一定的通风作用，然而这种自然通风系统，需要长时间的气体交换，并很大程度上依赖于外界气流的运动，有其不理想的局限性。
