主要区别是，性质不同、构造不同、用途不同，具体如下：
一、性质不同
1、碾子
碾子主要是指用人力或畜力把高粱、谷子、稻子等谷物脱壳或把米碾碎成碴子或面粉的石制工具。
2、石磨
石磨是指用人力或畜力把粮食去皮或研磨成粉末的石制工具。
二、构造不同
1、碾子
碾子由碾台、碾盘、碾滚和碾架等组成。碾盘中心设竖轴，连碾架，架中装碾滚子，多以人推或畜拉，碾盘和碾滚上分别由石匠凿刻着很有规则的纹理，其目的是增加碾制粮食时的摩擦力，通过碾滚子在碾盘上的滚动达到碾轧加工粮食作物的目的。
2、石磨
通常由两个圆石做成。 磨是平面的两层，两层的接合处都有纹理，粮食从上方的孔进入两层中间，沿着纹理向外运移，在滚动过两层面时被磨碎，形成粉末。
三、用途不同
1、碾子
把麦子、玉米等粮食脱壳或把米碾碎成碴子。
2、石磨
把米、麦、豆等粮食加工成粉、浆。
