南极企鹅的天敌有两类，一类来自空中，例如凶猛的贼鸥，另一类来自水下，可怕的豹形海豹。海豹会游泳，贼鸥会飞，所以企鹅的天敌是来自海陆空全方位的。
企鹅对付天敌的方法不多，对于空中的敌人，它们一般会集体鸣叫，脖子伸得老长，吓退敌人。如果这群企鹅不够合作，或者海鸟没被吓退，那么海鸟就会挑选最弱的那只企鹅下手，就算企鹅自己能脱身，企鹅蛋也保不住的。这种悲惨的事情在南极司空见惯，你要随便走上几步，便能看到被海鸟丢弃的蛋壳。
对于地面和海中的天敌，企鹅并没有什么有效的对策。企鹅甚至选择在冬季繁殖，以避开天敌们最活跃的季节。
