12V直流水泵和12V交流水泵原理和功能上区别不大。
两者的区别在于电机的不同：前者是直流电机，后者是交流电机。水泵的工作原理和功能基本无区别。目前市场上多为12V直流水泵，12V交流水泵在市场上基本不存在。
12V直流水泵：指用12V直流供电的微型水泵。微型水泵指具备一进一出的抽水口、排水口各一个，并且在进口处能够持续形成真空或负压；排水口处形成较大输出压力；工作介质为水或液体；体积小巧的一种仪器。也叫真空水泵、微型抽水泵、微型抽水机。这种微型水泵有自吸功能，在抽水前不用加引水。可以用开关直流稳压电源进行变压，也可以接车载电瓶，使用相当方便。对微型水泵来说，12v直流电是安全电压，相对于交流电水泵来说，使用上更安全。
微型水泵主要用于水处理、环保、医疗、工业控制、科研实验室等，需要满足体积小、噪音低、功耗低等需求，可以广泛用于水循环、冷却、提升、转移、增压、喷雾、喷洒、水循环、输送等用途。
