1、原料不同
全面粉的原料是整粒小麦，不除去麸皮和胚芽；黑全麦粉的原料是整粒黑小麦，也不除去麸皮和胚芽；小麦粉的原料是整粒小麦，但要除去胚芽，并根据加工等级，还要除去部分麸皮。
2、对应的产品标准不同
全麦粉对应的国家标准是粮食行业标准，即LS/T3244-2015《全麦粉》；黑全麦粉没有对应的国家标准，只有生产企业备案的食品安全企业标准，如Q/PLJⅩ0001S-2020《黑小麦全麦粉》；小麦粉对应的国家标准是GB/T1355-1986《小麦粉》，是小麦粉的等级标准。
3、膳食纤维素含量不同
全麦粉和黑全麦中的膳食纤维素含量比小麦粉的高(标准要求不低于9%)，不同等级的小麦粉，膳食纤维素含量差别较大，其中，特制一等小麦粉的加工精度最高，膳食纤维素含量最低(0.6%左右)，普通粉的加工精度最低，膳食纤维素含量最多。
全麦面粉是将整个小麦粗磨而成的面粉，黑麦面粉是将黑麦磨碎而成的面粉。由于全麦粉含有小麦胚乳、麦麸、胚芽等，因此全麦粉的矿物质含量高于黑麦粉，黑麦粉更适合做面包。但是黑麦粉韧性差，所以经常和全麦面粉混合做面包。而且黑麦粉中蛋白质含量相对较低，用水搅拌不能形成面筋，进一步建议搭配全麦面粉使用。
