巴布亚企鹅，继帝企鹅和王企鹅之后，是企鹅家族中体型第三大的企鹅。
巴布亚企鹅体长51-90厘米。雄性巴布亚企鹅在换羽前可重达8.5公斤，交配前最少重约4.9公斤。雌性在换羽前体重可达8.2公斤，但是在孵出幼雏后，体重会降至4.5公斤。巴布亚企鹅北方亚种幼雏平均重700g，比南极半岛的亚种幼雏重、且平均高10cm，巴布亚企鹅南极半岛亚种幼雏体长75-80cm 。
巴布亚企鹅很容易区分于其他企鹅，它们有着鲜艳的橘红色的嘴和脚，眼睛上方有着明显的白色斑块，。白斑通常从眼睛上方延伸到头顶呈倒三角形，雌性的白斑比雄性略小。巴布亚企鹅尾巴相当长——比其它所有企鹅都突出 。
它们的尾巴有着14-18根羽毛，长约15厘米。在企鹅的尾巴底部腺体会分泌油脂覆盖羽毛，使得它们的羽毛具有防水性。
帝企鹅最大，休高1.5米；王企鹅其次，体高1.0米；排第三的是秘鲁企鹅，体长65厘米左右。秘鲁企鹅也叫洪氏环企鹅。洪氏环企鹅的名字来源于流经秘鲁和智利海岸线的亨博尔特冷流，该冷流为秘鲁企鹅提供了丰富的食物资源。秘鲁企鹅曾不受干扰地生活在高低不平且非常陡峭的海岸和近岸的岛屿上。它们的粪便，积聚在繁殖地上，有时甚至达到了很厚的程度。
这些鸟粪做为肥料曾一度被过度地开采，破坏了秘鲁企鹅的繁殖地，导致其数量急剧下降。
