有以下区别：
1、营运主体不同
主飞航班由该航空公司派出飞机及机组成员等一系列安排，而代码共享航班是由另外的航空公司运营。共享航班同一个时间有两个航班出港，机场有两条或者更多的跑道供使用。如果共享航班是同一个目的地，一般不会出现相同的时间来起飞两架飞机。
2、服务主体不同
共享航班指两个航空公司合作，其中一个度航空公司允许销售另一个航空公司的某个航班的机票，前面会有一个*号标志（如*MU1111），实际承运的是另一家航空公司，从登机到机上全部由承运公司提供服务。主飞航班只有一家承运公司。
3、实际乘坐不同
共享航班是一家公司营销而由另一家公司运营的航班。即旅客在全程旅行中有一段航知程或全程航程在A航空公司购买的机票，实际乘坐的是B航空公司航班，这就叫代码共享。
主航班和共享航班最主要的区别就是乘坐方式不同，当乘客成功购买共享航班的飞机票之后，是需要前往另外一个航班公司内乘坐航班的。如果是购买主航班的飞机票，也就只需要在购买飞机票的航空公司去乘坐飞机。
