西南交通大学有3个校区，分别为九里校区、犀浦校区和峨眉校区。
犀浦校区：
犀浦校区为主体校区，重点批次本科学生和部分研究生在犀浦校区。占地3000亩，总投资逾20亿元，建设思路以人为本。
九里校区：
2008年学校工作重心转移，主校区由九里迁至犀浦校区，九里校区功能定位为国家实验室（筹）及主要支撑学科的研究生、继续教育基地，占地1000余亩。
峨眉校区：
1989年西南交通大学主体迁往成都市，同年在峨眉原址设立西南交通大学峨眉分校。2003年峨眉分校更名为峨眉校区。 西南交通大学峨眉校区坐落在风景秀丽、拥有世界文化和自然双遗产的峨眉山风景区内，占地1033余亩，建筑面积28万平方米。是四川省、乐山市、峨眉山市"园林式单位"，素有"花园学府"之美誉，校区是工作、学习、科研和生活的理想之地，也是教育部所属高校中唯一一所地处双遗产风景区的高等院校。
