印尼和马来人有一些明显的区别，主要体现在文化、宗教和语言方面。
文化：印尼文化深受印度尼西亚本土、中国和伊斯兰教的影响，而马来文化则主要受到印度和伊斯兰教的影响。在文化表现上，印尼人较为保守，而马来人相对开放。
宗教：印尼人主要信仰伊斯兰教，而马来人也信仰伊斯兰教，但并不像印尼人那样严格。在印尼，女性无论在任何场合都必须包着头巾，而在马来西亚，女性则没有这样的要求。
语言：印尼语和马来语在发音和用词上有一些不同，但两者可以互相理解。在书写上，印尼语使用的是拉丁字母，而马来语则使用的是阿拉伯字母。
服装：在服装上，印尼人比较保守，女性在办公时通常穿裙子和有袖的短外套，避免色彩过于鲜艳。而马来男子的传统服装包括长到足踝的布质沙笼和上衣“巴汝”，女性则穿宽大如袍的上衣和沙笼。
总的来说，尽管印尼和马来人在一些方面存在差异，但他们之间并没有根本的区别。
马来人是印尼的一个种族，只不过被赶到了马来西亚。马来人是印尼看不起的种族，在印尼语中，马来尤是懒惰族，带有贬义，但是在以前的年代，印尼也是马来西亚的马六甲王朝领地。印尼语和马来语是大同小异，就是句子的排列顺序，和一些用词比较不一样。马来语和印尼语还是能够互通的。因为上述的一些问题，马来西亚和印尼还是比较不和的，虽然是同一个种族，却互相不爽。
建立马来西亚之初，印尼拒绝加入马来西亚，还派间谍和空军，有一些军事冲突。
