1、放在阴凉干燥的处所就可以保留两个月左右，要将窝瓜的瓜柄朝上放，否则会加快其糜烂。
2、提前准备好一块干燥的木板，可以将木板清洗干净，放到太阳下暴晒几天，起到杀菌的效果；将窝瓜用干抹布抹去表面的污渍，用报纸包住两边（如果觉得麻烦，也可以不用报纸），然后一个个的码放在木板上。窝瓜保存的地方，最好选择阴凉通风，而且无阳光直接照射的地方。
可以贮藏在空屋内或湿度较低的窖内，地面铺细砂、麦秆或稻草，堆放南瓜时要留出通道，以便检查。
南瓜可将瓜蒂朝里，瓜顶向外逐个依次码成圆堆，每堆15―25个，高度以5―6个瓜高为好。也可装筐堆藏，每筐不能太满，筐口应留有一个瓜的距离，以利通风和避免挤压。瓜筐堆放可采用骑马式，以3―4个筐高为宜。贮藏初期（秋季），通风要降温排湿，贮藏后期（严冬）温度保持0℃以上。
