1、位置不同
中山大学南方学院在广州市从化区；
中山大学新华学院有两个校区：广州校区在广州市天河区；东莞校区在东莞市麻涌镇；
2、创办时间不同
中山大学南方学院创建于2006年；
中山大学新华学院于2005年经教育部批准设立。
3、侧重不同
中山大学南方学院侧重于文化艺术类；
中山大学新华学院则是偏向经济贸易方向。
中山大学是公办重点大学，中山大学南方学院是民办独立学院（三本），是由中山大学和珠江投资公司共同建立的。中山大学对南方学院的教学和管理负责，学院领导班子、中层管理干部由中山大学和珠江投资公司共同派出，全面负责学院的管理工作。
