放些活性炭能起到净水作用，它能吸附有毒物质，但不能把水弄干净。想要鱼缸保持干净要靠换水和过滤系统来完成。
可以放入少量的净水剂。净水剂的作用是把缸中混浊的悬浮物凝聚为絮状物，由过滤器或吸管吸出缸外。也可用于检测鱼缸中的水是否干净，毕竟是化学药品，对生物没好处，尽量少用，或者不用。
最好的方法是在缸里建立硝化系统。可以适量地加入新活的硝化细菌，这样能补充及提升缸内的硝化细菌数量，当硝化细菌量提升到足够的时候，就能够处理水中的杂质，令水质清澈。要保养这清澈的水质，须注意投喂的份量不能太多，适量的换水，鱼缸的生态得到自然的保健，那么就不必经常在鱼缸添加清水剂等等的化学药品。
