如果是运输服务公司，那么应该可以开具运输业普通发票，然后按照营业税缴纳5%。 如果是一般纳税人。而且是销售货物的企业，只不过同时收取了运费，那么只能把运费和销售收入合并计算，开具专用发票，而且按照合计收入的17%缴纳增值税销项税 运费÷（1+17%）×17% 如果是小规模的那么就按照 运费÷（1+3%）×3% 运杂费是算增值税的价外收入，是含税的，需要换算为不含税后乘以增值税率。税率按运输的货物所适用税率。 增值税是对销售货物或者提供加工、修理修配劳务以及进口货物的单位和个人就其实现的增值额征收的一个税种
1.设备运杂费的构成
设备运杂费通常由下列各项构成：
（1）国产标准设备由设备制造厂交货地点起至工地仓库（或施工组织设计指定的需要安装设备的堆放地点）止所发生的运费和装卸费。
进口设备则由我国到岸港口、边境车站起至工地仓库（或施工组织设计指定的需要安装设备的堆放地点）止所发生的运费和装卸费。
（2）在设备出厂价格中没有包含的设备包装和包装材料器具费；在设备出厂价或进口设备价格中如已包括了此项费用，则不应重复计算。
（3）供销部门的手续费，按有关部门规定的统一费率计算。
（4）建设单位（或工程承包公司）的采购与仓库保管费。它是指采购、验收、保管和收发设备所发生的各种费用，包括设备采购、保管和管理人员工资、工资附加费、办公费、差旅交通费、设备供应部门办公和仓库所占固定资产使用费、工具用具使用费、劳动保择费、检验试验费等。这些费用可按主管部门规定的采购保管费率计算。
2.设备运杂费的计算
设备运杂费按设备原价乘以设备运杂费率计算。其计算公式为：
设备运杂费=设备原价*设备运杂费率
其中，设备运杂费率按各部门及省、市等的规定计取。
一般来讲，沿海和交通便利的地区，设备运杂费率相对低一些；内地和交通不很便利的地区就要相对高一些，边远省份则要更高一些。对于非标准设备来讲，应尽量就近委托设备制造厂，以大幅度降低设备运杂费。进口设备由于原价较高，国内运距较短，因而运杂费比率应适当降低。
