1、准备附着物
硝化菌需要依附在某种物质上才能生存，因此要为其准备附着物，通常表面积较大、有许多孔的材料最为适合，例如生物球、陶瓷杯或者沙石，同时附着物的体积最好是鱼缸水体的20%。
2、控制温度
硝化菌对于温度的变化非常敏感，在培养中需要将气温控制在5-35℃之间，确保其可以进行代谢活动，如果温度过高，硝化菌难以生活，严重是会出现大量死亡的情况。
3、增加氧气
要想提高硝化菌的成活率，需要将氧气泵增大，使鱼缸中能产生大量的氧气，并且硝化菌培养时间在24小时以上，在这期间，要尽量避免光照，可以将鱼缸中的灯关闭。
4、自然生长
硝化菌不需要经过特殊的培养才能出现，鱼缸在正常运转的情况下会自然而然的长出硝化菌，一般在淡水中需要1-2周的时间能培育出成熟的硝化菌，海水中大概要1-2个月才能长出，如果急需硝化菌，可以直接在市场上购买成品放入鱼缸。
培养硝化细菌，可以使用干粉硝化菌倒入鱼缸来进行培养，然后将酵母粉或活性酸奶用温水化开倒入缸中，还能放入小鱼来给硝化菌提供食物。
在培养硝化细菌的过程中，一定要保证水质的稳定，尽量不要大幅度的进行换水，并保持温度在23～29℃以内。
培养硝化细菌的时候，还可以增加缸内的氧气，能够有利于硝化细菌的繁殖和生存，同时放置滤棉滤材等物品供硝化细菌附着就行了。
