蚯蚓粪最常见的使用方法就是拌土使用，一般使用量占三分之一左右。如果种植花草的时候，要使用园土栽种的话，可以园土一份，蚯蚓粪一份，这样搭配的话，土壤也不会板结，并且蚯蚓粪的表面积比较大，可以附着更多的微生物，让土壤具有更多的养分被吸收。
用蚯蚓粪一份，椰糠一份拌匀之后，撒施在土壤的表层，可以让土壤更加的保湿和透气。有一些花土透气性比较好，就比较容易干燥，就可以撒施一些蚯蚓粪在土壤的表层，起到保湿的作用，还能提高土壤的有机质含量，让花盆里的土壤再用一年。
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蚯蚓粪主要用于生物肥、改善土壤、解毒、吸附剂、预防病虫害等方面，和一般的肥料不同的是，它无臭、无味、呈粒状、吸水渗透性较好。
