燕窝因为昂贵，有的人连浸泡的水也舍不得倒掉，其实作为燕子的巢乃栖息和孵蛋育雏之用，洗净弃除杂质是绝对必须的，更何况市面上漂白、扫浆涂料者比比皆是，所以燕窝在炖食之前一定要彻底洗净。
所有燕窝皆不宜用热水浸泡，避免燕窝中之可溶性蛋白流失浪费。乾燕窝一般要浸泡4个小时以上，最久的甚至要超过24小时。待燕身胀发松软后用手撕开成原始的条状和片状(燕角部份)，倒去浸泡的水，再反复用较多的清水冲洗。残留的细小茸毛和杂质会悬浮在水中，然后轻轻倒弃，小心不要让下面的燕窝也跟出。倒去水后，轻轻用手把燕窝抓到另一容器之中，而先前器皿的底部若有小量沉下的杂质可小心分出，如此反复数次直至完全乾净为止。用冻水浸泡~炖时用纯正水或普通清水
