存放最好选择棕色玻璃瓶保存可抗氧化，所以深棕色玻璃瓶最为合适容器。
存放天麻最好选择瓶盖有胶皮内垫的玻璃瓶，胶皮内垫可以很好地密闭封口，瓶子最好是棕色的，因为可以抗氧化，如果是浅色瓶子可能下次取出天麻就发现天麻的颜色已经变深了。
玻璃瓶务必洗净晾干，确保干燥。把天麻用纸包好放入瓶子以后，有条件的话，可以适当放入干燥剂，如生石灰、木炭、硅胶等，然后将瓶口加盖密封，放入冰箱冷藏室保存，这样可以防虫蛀、霉变，也可以避免冰箱内物品串味，或药味走失。
干天麻要晒干，用保鲜袋装好放入密封容器中，再置于冰箱里可以保存很长时间。
