仓鼠在饲养的过程中可以经常洗澡，而关于笼舍以及用品的消毒，一般通常使用酒精、新洁尔灭或者次氯酸溶液，一般都会采取浸泡消毒法，可以有效杀灭绝大多数的病原微生物，但是在浸泡过后需要进行晾晒，因为这些消毒液都有浓重的气味，很可能会对仓鼠造成不适，同时火焰灭菌等非常规灭菌手段也有使用。
在清理工作开始时，首先要将鼠鼠放置安全。外带笼最好不过了。可以不用提供过多的物品玩具以及食物和水，毕竟在这里待不长时间。
清洗会用到酒精和消毒水。酒精的刺激性较强，所以清理时，鼠鼠一定要远离，最好准备个其他笼子（暂时的）。擦拭过的物件要放在通风处凉干，再拿干净毛巾擦拭一遍。
消毒水可以自制，最常见的就是84泡腾片了，也很简单，需要提醒的是84泡腾片有轻微腐蚀性，注意防护措施。84的刺激性比酒精要大，所以清理完笼子等环境，需要一定时间挥发，放在通风处晾干即可，这样寄给小仓鼠带来了干净的环境，家里也不会搞的太糟糕。
