一，挂牌成本不同
挂牌成本基本包括中介机构的费用和挂牌收取的费用。新三板挂牌成本在120万左右，不同区域性股权市场的费用不同，大体成本在70万左右。新四板挂牌成本（包括挂牌、融资辅导、融资对接）一般在10万元以内。
二，融资功能不同
新三板主要为挂牌企业提供股权融资，新四板主要为企业提供挂牌、登记、托管、转让、展示服务以及各类股权、债权、金融产品等服务。
三，市场活跃程度不同
新三板为非上市公众公司，股东人数可以超过200人。新四板为非公众股份公司，股东人数在２-200人。
四，股价形成机制不同
新三板挂牌企业依据股票交易形成价格，新四板的区域性股权交易中心挂牌企业根据公司净资产确定股价。
已经挂牌新四板的规范中小型企业可以转新三板。
