1、细菌含量不同
无菌蛋是经过巴士杀菌法来进行过消毒的鸡蛋，它从一开始就受到严格的控制和处理，它里面所含有的有害的细菌很少，是能够生吃的。但并不是所有的菌都被杀灭掉了，有一些细菌是巴士杀菌法所不能杀灭的。所以无菌蛋并不是没有细菌，只是相对于普通蛋来说细菌比较少罢了。
2、包装不同
相对于普通鸡蛋超市里面无菌蛋的包装一般都会打上“P”的字样，表示这些蛋是经过严格加工处理过的鸡蛋可以放心食用。 另外有些无菌蛋甚至还会打上“最佳食用日期”的标示，以确保无菌蛋不会过期。
3、口感不同
日本无菌蛋鸡蛋是一款可以生食的蛋，并且相对于普通鸡蛋来说，无菌蛋的味道醇香自然，并且不会有很大的腥味，蛋内所含的细菌也是非常少的，蛋内有机硒比普通蛋高3.6倍。 而普通的鸡蛋有一种腥味，若是不煮熟而直接生吃的话，它里面所含的那种腥味让很多人受不了。
