大老土将天然的金刚菩提籽的颜色分为红色和黄色两种主色，也是金刚菩提籽的两类基本色调。在红色和黄色两色之间，又有偏橙色以及偏紫色之分。通常情况下，以颜色将金刚菩提子区分为黄皮、红皮、紫红皮3类。当然，金刚菩提籽还有介于这几种颜色之间的颜色，比如比黄色更为灿烂的金黄色以及比红色更为深艳的绛红色等等。
非天然的经过加工后的金刚菩提也会具有艳丽的颜色，比如染红色的金刚菩提、双氧水泡成的金黄色还有就是许多为了遮住金刚瑕疵而过量上油而显得颜色深沉。这些经过加工处理的金刚大家需要格外注意和辨别。
那么，具体选择什么颜色的金刚菩提主要还是取决于盘玩者个人的喜好。
