你好，在绝大多数的论文写作软件（如Microsoft Word、LaTeX等）中，都可以通过以下步骤为参考文献序号加上方括号：
1. 打开论文中的参考文献列表，选中所有的参考文献序号（如1、2、3等）。
2. 在菜单栏中找到“格式”或“样式”选项，选择“段落格式”或“样式设置”。
3. 在弹出的窗口中找到“编号”或“编号格式”选项，选择“方括号”或“[ ]”格式。
4. 点击“确定”保存设置，完成参考文献序号加上方括号的操作。
需要注意的是，不同的论文写作软件可能具体操作略有不同，但大体步骤是相似的。另外，在使用LaTeX编写论文时，可以通过调整文献引用样式来实现参考文献序号加上方括号的效果。
