主要差别是生殖系统。男女生理结构差别，主要体现在生殖系统方面，其他的差别不大。男人、女人都有完美的生殖系统，正是这种差别才分出了男女。
男性和女性在身体结构和生理功能方面均存在着一定的差异。
主要表现在以下几个方面：
1、骨骼 男性骨骼较宽大，俗称大骨架;女性骨骼较窄小，故有苗条淑女之说。从青春期，即指十二三岁至十七八岁间，男女两性第二性征逐渐明显。男性骨骼呈上宽下窄型，表现为肩宽背阔，下肢窄而长;而女性骨骼以上下窄、中间宽为特点。随着发育的日益成熟，女性骨盆明显变大，肩相对较窄，很多女性往往出现大屁股状。因此，男女的骨骼和形体上就出现了较大的差异，逐渐生长发育，男性个子多数会比女性高，体重也会出现不同，一般男性比女性体重重些。
2、肌肉、脂肪 青春期后，男女发育加快，区别也越来越明显。女性表现为皮下脂肪增厚，乳房增大，胸部、腰部、臀部和下肢部的曲线日趋明显，女性出现了曲形线条美。这与骨骼发育变化有关，但更多的因素是女性脂肪厚。但男性则表现为肌肉明显发达，尤其是背肌、臂肌和小腿肌明显增多，逐渐显现出力量和阳刚之气，表现了男人膀大腰圆的男子汉的气质。这里男女区别的关键是脂肪和肌肉。
3、皮肤 发育成熟期的男性，皮肤较厚，表皮略显粗糙，而女性皮肤则比较细嫩、白皙，更容易受到机械、化学、日光及生物有害因素(如昆虫)的侵袭。
