菩提根本身是一种木材，和其他木材一样，可以进行水洗。不过需要注意的是，水洗后要及时晾干，避免过度湿润导致发霉或变色。另外，菩提根多用于佛教文化中的佛珠、佛像等物品，用水洗可能会磨损或破坏其表面的装饰或保护层，所以在清洁时最好采用专用的清洁剂或干布擦拭。
菩提根手串是怕水的，在佩戴时尽量不要沾水，由于它是一种木质材质，若是长期沾水后，容易导致表面潮湿后出现发霉的现象，当不小心沾水后应及时擦干，放在阴凉处晾干即可。菩提根手串属于木材质，因此沾水后会导致手串湿度过大，手串出现糜烂、开裂的几率会大大增加，对于手串的保养很不利。
