奇门遁甲是由九天玄女发明,传授于轩辕黄帝,后经历多带人改良形成。关于奇门遁甲的起源,在古籍《秘藏通玄变化六阴洞微遁甲真经》、《轩辕本纪》、《烟波钓叟歌》等多有记载,大致为当年蚩尤作乱,黄帝频战不克,九天玄女授奇门遁甲术于轩辕黄帝,助黄帝以灭蚩尤。