使用巴氏杀菌法的牛奶，处理温度较低，经过杀菌后，牛奶中还会保留少量耐热的细菌和细菌芽孢，因此不耐储存。一般保质期较短的牛奶，如保质期45天以内的牛奶，大多使用巴氏杀菌法。这类牛奶生产出来后，需要放在冷藏的环境中储存。
使用超高温灭菌法的牛奶，牛奶会经过超高温的瞬时灭菌处理，能够完全破坏掉牛奶中的细菌和细菌芽孢。这种杀菌方法杀菌比较彻底，因此生产出来的牛奶，一般能在常温下保存很长时间，像保质期为6个月的牛奶，就属于用超高温灭菌法处理的牛奶。
从杀菌方法上看，保质期45天的牛奶大多采用巴氏杀菌法，保质期6个月的牛奶则主要使用超高温灭菌法。
