事业单位的主管部门一般指的就是对事业单位业务具有指导和监管责任的直接领导机构。比如说学校的主管部门是教育体育局；文化宫、图书馆、博物馆等文化类事业单位的主管部门是文化和旅游局；医院等卫生事业单位的主管部门是卫生健康委。
指对事业机构（行政部门）有直接管理权力的党委、行政部门，主管部室是对某项权力或者业务、服务承担具体职能与责任的部室。
主管部门，是指同一政府管理级别中，对其他行政部门尤其是事业单位有直接管理权力的党委政府部门。按机构编制相关规定，主管部门肯定是使用行政编制的党政部门。比如主管文化宣传的部门，肯定是同级宣传部，包括同为党政机构的文化旅游体育局，也同样隶属宣传部管理。
