南航好
南航有一些工学学科比很多985大学实力更强。比如在最新的学科评估中，南航的机械工程是A-等级，东北大学（B+），
南航是“国防七子”之一，在国防领域的学科发展上，是比一般的985大学强的，目前共有15个国防特色学科。
东北大学更好。
两个学校都是很不错的全国重点大学，相比较而言东北大学应该是更好一些。东北大学是“985工程”，南京航空航天大学是“211工程”，南京航空航天大学偏理工科类，东北大学综合一点。
1、东北大学是教育部直属的全国重点大学，由教育部、辽宁省、沈阳市三方重点共建，是世界一流大学建设高校，国家首批“211工程”和“985工程”重点建设高校，是全国首批博士、硕士学位授予单位。
2、南京航空航天大学是中华人民共和国工业和信息化部直属的一所具有航空航天民航特色、以理工类为主的综合性全国重点大学，是国家“世界一流学科建设高校”，国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”重点建设高校。
