1、范围不同：分校：大多是与“本部”在教学管理方面相独立的办学机构。大多是指与“本部”除地理区位不同外其余方面皆保持一致的“本校分部”，在各方面都直接受“本部”领导。
2、生源不同：（1）一般情况下，大学的“分校”没有独立招生的权力，其生源主要依靠校本部统招，再根据专业和年级分配到各个校区，因而生源质量有所保证。与“校区”相比，“分校”大多是与“本部”在教学管理方面相独立的办学机构。（2）其中一类便是由学校本部与地方政府合作开办的“分校”，例如，北京师范大学珠海分校(原北京师范大学珠海教育园区)即是教育部批准设立、由北京师范大学和珠海市人民政府合作举办、进行本科层次教育的全日制普通高等学校。
3、管理不同：“分校”大多是与“本部”在教学管理方面相独立的办学机构，而“校区”大多是指与“本校”除地理区位不同外其余方面皆保持一致的“本校分部”，在各方面都直接受“本部”领导。这两者前者更强调组织机构关系的“分立”，后者则强调组织关系的统一。
一、学校性质不同
大学里的本校一般称为公办学校或者一、二本学校；而分校则称为民办学校或者三本院校。本校一般由教育部和省市部门共同建设的大学，而分校一般是由公办学校结合社会力量办学，以“民办公助”的形式做一个分校，且分校大多是与本校在教学管理方面相独立的办学机构。
二、招生生源不同
一般本校的学生生源较好，录取分数较高，且招生范围广阔，面向全国省份招收；而分校一般是在本校学生招收完毕后，录取学生，分数较低，档次也较低。
三、毕业证含金量不同
对于本校的毕业生，学士学位证书，都是由本校名称命名，如中国矿业大学，代表是优秀的一本学生，是“211”、“985”重点大学出来的学生，含金量较高，就业平台好；而分校毕业生，如中国矿业大学徐海学院，是三本学校，档次大大降低。在找工作时会受一定程度的限制，没有本校毕业证含金量高。
四、学费费用不同
正常本校的学费较低，四五千左右；而分校的学费较高，一般一万五到两万元。若是有些中外合办的分校，价格更高。
