首先，没有哪个更好，你要选择适合你的那种。
上过滤：水泵入缸，吸水管深入水下层。吸取鱼缸下层水，通过水泵导入鱼缸顶层过滤槽，通过过滤棉净化后流入鱼缸形成水循环。
优点是：水循环彻底，流入鱼缸的水带入的气体可以使中小型鱼缸免加氧。
缺点：换洗过滤棉麻烦，过滤效果差。如果堵塞，容易溢水，损坏地板墙体家具等后果严重。
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下过滤：分好多种，绝大部分的鱼缸是通过高低差使水流入过滤槽，然后通过过滤槽流入底部数个过滤仓，最后流入水泵仓，通过水泵把过滤好的水抽回缸内。
优点：数个过仓使得水质过滤效果极佳。过滤材料换洗方便。同样下过滤换水也方便。
缺点：水循环差。下层水无法过滤。如果发生淤堵，会造成溢水，后果比上过滤更加严重，你回到家看到的可能是一片汪洋。
侧滤：跟下过滤有些相同，有数个过滤仓，甚至有杀菌仓、沉淀池、培菌仓等等。一般位于鱼缸侧面，也有与鱼缸同体，通过水位高低差过滤，也可以加入水泵抽水过滤，抽水过滤可以抽取任何水位，过滤仓多净水效果也高，换洗方便。侧滤发生溢水的现象风险小。唯一的缺点是：不美观
