根据植物雌蕊和雄蕊的有无，花可以分为两性花和单性花，在一朵花中同时具有雌蕊和雄蕊的花叫做两性花，在一朵花中只有雄蕊或只有雌蕊的花叫做单性花。
辣椒的花，每一朵花同时具雌蕊和雄蕊，是两性花。
花开花后，必须经过传粉和受精两个生理过程，才能结出果实，在雄蕊的花药里含有许多花粉，在花成熟时，这些花粉会从花药里散落出来，花粉从花药散落出来后，落到此蕊柱头上的过程叫做传粉，当花粉成熟后从花药中散落到雌蕊的柱头上，花粉就在雌蕊分泌的粘液的刺激下生出花粉管，花粉管穿过花柱，进入子房，一直到达胚珠的珠孔，将精子输送到胚珠与卵细胞在胚珠中结合，形成受精卵，这过程就叫受精。
辣椒属于茄果类植物，花粉属于雄雌同蕊，雄花在上、雌花在下，在生长过程中借助风力自然授粉，不需借助媒介。
至于室内种植辣椒，也可以人工辅助授粉。可用小手指的指肚尖（或医用棉签）碰碰这花的花蕊再碰那花的花蕊 ，直到碰遍，可以反复多次，效果很好
