同源性（homology）是指在分子进化研究中，同源性一般是指两种核酸分子的核苷酸序列之间或两种蛋白质分子的氨基酸序列之间的相似程度。序列分析是最终测定同源性程度的方法，DNA—DNA杂交或DNA—RNA杂交也是有用的估计途径。
特性
同源性是比较生物学中的一个中心概念。同源，最基本的意义就是具有共同祖先。一般来说，如果两个物种中有两个性状（状态）满足以下两个条件中的任意一个，就可以称这两个性状为一对同源性状：
（1）它们与这些物种的祖先类群中所发现的某个性状相同；
（2）它们是具有祖先—后裔关系的不同性状
