肥料可按不同的施用时期、施用目的和方法，分为基肥、种肥和追肥等。
基肥在播种或移植前结合土壤耕作施入土壤中的肥料。通常以有机肥料为主。其作用是培肥土壤和在植物整个生长期间供应养分。为了充分发挥基肥的作用，常根据土壤特点、耕作方式和肥料性质等采用不同的施用方法如撒肥、条施、分层施肥等。
种肥在播种或定植时施于种子附近或与种子混播的肥料。目的是供给幼苗生长所需的养分。在中国，种肥施用有多种方法：将肥料与植物种子拌和后播种，称拌种;植物种子用稀薄肥料溶液浸泡后播种,称浸种；植物移栽时将根在拌有泥浆的肥料中浸蘸，称蘸秧根；植物种子播种后用土粪、焦泥灰等覆盖于种子之上，称盖种肥。
追肥在植物生长期间施用的肥料。旨在补充和满足植物生长期间对养分的需求。通常以施用快效性化肥和腐熟的有机肥料为主。追肥方式主要有撒施、环施和喷施等。结合喷灌、滴灌施肥省工、省肥、效果好。适合于灌溉施肥的肥料主要是氮肥，磷肥因易与灌溉水中的盐类起化学反应，形成难溶性化合物而堵塞喷灌口的小孔，故不宜采用。
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