一是土壤贫瘠、营养不足。土壤贫瘠，耕作层较浅，蓄水保肥能力差，极易导致玉米缺粒现象的发生。单一施用化肥，不施或少施农家肥，且氮、磷、钾配比不当，尤其是土壤中磷肥、硼肥不足，或玉米生育中后期，水肥供应不足，影响有机质的合成与运转，使玉米吐丝较晚，田间花粉减少，花粉、花丝寿命缩短，必将导致玉米缺粒;
二、干旱、大风等不良天气容易造成玉米缺粒。玉米生长过程中，特别是其生长的中期，如果遭遇连续干旱，将会造成多次卷叶，而开花时如果遇到高温干旱天气，土壤水分供应不足，会影响了玉米雌、雄穗的发育，造成部分花粉败育或形成畸形花粉，影响受精，形成空粒。
