土壤有机质是指土壤中含碳的有机化合物。土壤中有机质的来源十分广泛。
植物残体：包括各类植物的凋落物、死亡的植物体及根系。这是自然状态下土壤有机质的主要来源。对森林土壤尤为重要。森林土壤相对农业土壤而言具有大量的凋落物和庞大的树木根系等特点。
动物、微生物残体
包括土壤动物和非土壤动物的残体，及各种微生物的残体。.这部分来源相对较少。但对原始土壤来说，微生物是土壤有机质的最早来源。
排泄物和分泌物
土壤有机质的这部分来源虽然量很少，但对土壤有机质的转化起着非常重要的作用。
废水废渣
人为施入土壤中的各种有机肥料（绿肥、堆肥、沤肥等），工农业和生活废水，废渣等，还有各种微生物制品，有机农药等。
