这个概念和你想象的不一样。
你可以找一个序列分析软件,例如DNA Star等,将你的DNA序列放进去,就会搜出所有的酶切位点。基本上很多位置都会有不同的酶切位点,如果在非编码区有某一种限制性内切酶的酶切位点,而你又刚好要使用这个酶的话,就有可能会切到启动子。但是通常,大家在分析了酶切位点后,都会避开在目标序列范围内带有的限制性内切酶,选用其他不会在此处切开的酶。而启动子序列有各种不同的组成,有可能一部分是有酶切位点的部分序列,但是不能肯定。因为如果是未知的启动子,你通过软件去预测的话,是拿不到准确的序列的。